Digital Counting

nCounter는 cDNA 재합성 과정과 PCR amplification 과정 없이 Direct probe hybridization을 통해 유전자 발현량을 측정하는 기술입니다. Single tube에서 최대 800개 유전자를 동시 분석하는multiplexing이 가능하다는 장점이 있습니다. LAS의 nCounter 서비스는 hybridizationbase이기에 FFPE 샘플이나 poor quality RNA 샘플에서도 정확하게 분석이 가능하며, mRNA와 miRNA 분석을 제공합니다.


mRNA

GeoMx DSP(디지털 공간 프로파일러)는 단 하나의 슬라이드에서 전사체학 및 단백질체학 의 형태학적 정보를 제공합니다. GeoMx DSP는 끊임없이 변화하는 연구 요구 사항을 충족하도록 설계된 가장 유연하고 강력한 공간 생물학 솔루션입니다. 공간 생물학은 2D 또는 3D 내에서 조직에 대한 연구로 정의되며 분자 생물학의 새로운 영역입니다. GPS가 지역 내의 위치 좌표를 캡처하여 지도를 만들고 그 안에서 추적하는 것과 같은 방식으로 동일한 원리를 세포 및 분자 수준으로 적용 할 수 있습니다. 이 기술을 통해 세포의 공간 구조와 세포가 주변 환경과 어떻게 상호 작용하는지 연구하는데 도움을 줄 수 있습니다. DSP는 조직의 공간을 시각화하고 샘플의 여러 바이오마커를 분석하는 소프트웨어를 사용하여 공간 유전체학 및 공간 전사 체학의 연구를 가능하게 합니다. 전체 조직의 절편, FFPE 또는 신선 냉동조직을 RNA 또는 단백질에 대해 염색하고 이미지화하여 프로파일링할 조직 구획 또는 세포 유형을 정확하게 선택한 다음 해당 부분만 선택적으로 추출하여 nCounter Analysis System 또는 Illumina Sequencer를 사용하여 발현 수준을 계산할 수 있습니다.

샘플 필수 항목

  • 100~300ng RNA

  • Greater than 300 nucleotides >50%

  • A260/A280 ratio of 1.7–2.3

  • A260/A230 ratio of 1.8–2.3동 조직

실험정보

적용가능연구

  • Population genetics

  • Genetic rare diseases

  • Cancer research

실험 과정 및 기간

생물정보 분석 파이프라인

분석결과

  • RNA expression files (Raw count, Normalized count)

  • Differential analysis results

  • Functional analysis results


miRNA

nCounter Analysis System는 800개 이상의 대상(유전자)에 대한 다중 분석을 위한 효율적인 자동화 솔루션을 제공합니다. 적은 양의 RNA(100ng~300ng)을 사용하며, 간단한 실험 방법으로 재현성이 높은 데이터를 생성합니다. 또한 기존 유전자발현분석을 위한 PCR의 증폭과정이 필요하지 않습니다. 해당 시스템은 역전사가 필요하지 않아 데이터 오류의 원인이 줄어듭니다. 사용 가능한 샘플 유형의 경우 광범위합니다. 추출된 RNA, 세포 용해물 뿐만 아니라 FFPE와 같은 분해된 샘플도 호환됩니다. nCounter 기술은 유전자 발현 분석, 고형 종양 프로파일링, 면역 종양학 프로파일링, 유전자 융합 분석, 단일 세포 유전자 발현 분석, miRNA 발현 분석, 카피 수 변이 분석을 포함한 광범위한 발견 및 연구 응용 분야에 이상적입니다.

샘플 필수 항목

  • 100ng RNA

실험 정보

적용 가능 연구

  • Population genetics

  • Genetic rare diseases

  • Cancer research

실험 과정 및 기간

분석결과

  • RNA expression files (Raw count, Normalized count)

  • Differential analysis results

  • Functional analysis results