Digital PCR

독보적인 droplet 생성 기술을 바탕으로 한 droplet-based digital PCR로서, 기존의 detection limit 한계를 넘어선 기술입니다. PCR 반응을 2만 개 droplet으로 쪼개어 증폭 시킨 후, droplet내 target DNA의 증폭 여부에 따라 positive droplet(1)과 negative droplet(0)으로 계수하고, 프아송 분포를 통해 copy 수로 결괏값을확인할 수 있습니다.

Copy Number Variation

CNV는 암, 신경 질환, 자가 면역 질환, 약물 부작용 등과 깊은 관련이 있는 것으로 알려져 있으며, 시료간 copy number의 차이 를 명확히 수치화 시키는 것이 중요합니다. dd-PCR은 droplet을 이용한 partitioning으로 CN의 resolution을 높였습니다.

고객제공

  • 분석 시료: Genomic DNA 500 ng (50ng/ul 이상)

  • Primer/Probe set: FAM probe (target), Hex probe (reference)

  • Restriction enzyme: target과 reference sequence를 피하여 선택

  • Recommended enzyme: CviQl, MseI, AluI, HaeIII, BsmI, BstY1, Hind III, EcoRI

실험정보

실험 과정 및 기간

분석결과

  • One-Dimentional Histogram (Positive and Negative droplet)

  • Concentration (copies/ul)

  • Copy number variation

Rare Mutation and Sequence Detection

Droplet Digital PCR은 높은 민감도와 정확도를 갖고 있습니다. 다양한 시료에서 매우 낮은 농도로 분포하는 pathogen이나 mutant의 검출이 가능합니다.

고객 제공

  • 분석 시료: Genomic DNA, Cell free DNA, FFPE DNA

  • Controls: Negative control (Wild type DNA, matrix DNA), Positive control (Mutant DNA, pathogen DNA)

  • Primer/Probe set: Assay 에 맞춰 제공- 일부 mutation은 screening kit, 또는 primer/probe set 판매

실험 정보

Assay Schematic

실험 정보

실험 과정 및 기간

분석결과

  • One-Dimentional Histogram (Positive and Negative droplet)

  • Concentration (copies/ul)

Gene Expression

Digital Droplet PCR의 높은 민감도와 정확도로, 낮은 농도로 발현하는 유전자의 정량 및 샘플간 미세한 발현량 차이의 분석이 가능합니다. 절대정량, Normalized RNA Level 비교로 보다 유의한 실험 결과값을 제공 하며, Probe assay, Evagreen assay 선택의로 편리성을 더했습니다.

고객 제공

  • 분석 시료: Total RNA, mRNA, miRNA, cDNA

  • Primer/Probe set: :FAM probe (target), Hex probe (reference, option)

  • miRNA는 사용 가능한 miRNA cDNA synthesis kit 정보

실험 정보

실험 과정 및 기간

실험결과

  • One-Dimensional Histogram (Positive and Negative droplet)

  • Concentration (copies/ul)

  • Ratio : target/reference